Im Gegensatz zum Ligasystem bei der Profimannschaft sind die Ligen im Jugendinternat frei wählbar und können in einem gewissen Rahmen individuell gestaltet werden.

Es können folgende individuelle Einstellungen vom Gründer an der Liga vorgenommen werden:

1. Größe der Liga
2. Tag und Uhrzeit der Spiele
3. öffentlich oder privat
4. International oder auf bestimmte Regionen/Länder begrenzt

Die Größe der Liga bestimmt zugleich die Anzahl der Spiele, da immer eine Hin- und Rückrunde gespielt wird. Die Ligengrößen können zwischen 4, 6, 8, 12 und 16 Teilnehmern gewählt werden, wobei die Gründung einer 12 und 16 Teilnehmer-Liga den Supportern vorbehalten ist.

Einer nationalen Liga kann jede Mannschaft beitreten, solange sie keiner anderen Liga und der entsprechenden Region bzw. dem Land zugehört. Bei internationalen Ligen gibt es keine Beschränkung hinsichtlich der Region.

Wer einer privaten Liga beitreten will, der muss neben der Erfüllung der oben beschriebenen Restriktionen vom Ligagründer eine Einladung erhalten. Das Erstellen einer privaten Liga ist ebenso nur Supportern vorbehalten.

Solange eine Liga nicht vollständig mit Teilnehmern gefüllt ist, kann die Jugendliga nicht gestartet werden. Erst wenn alle Teilnehmerslots gefüllt sind, startet die Jugendliga automatisch. Somit kann es sich durchaus lohnen eine zuvor private Liga in eine öffentliche Liga zu ändern, sollten sich nicht genug Teilnehmer finden lassen.

Sobald eine Saison im Jugendinternat gespielt wurde, kommt es zu einer einwöchigen Unterbrechung der Spielzeit. Während dieser Unterbrechung können die oben aufgeführten Einstellungen an der Liga verändert bzw. aus einer Liga ein- oder ausgetreten werden. Des Weiteren besteht die Möglichkeit einer Löschung der Liga durch den Ligagründer.

Sollten die Veränderungen an der Liga bzw. das Auffüllen offener Plätze innerhalb dieser Woche vollzogen worden sein, dann startet direkt die nächste Saison. In dem Falle geht die Liga direkt weiter, so dass man nicht unbedingt von einer Saisonunterbrechung sprechen kann.

Während der Saisonpause bei der Profimannschaft kommt es aus Wartungs- und Anpassungsgründen zu einer einwöchigen Unterbrechung aller Jugendligen. Die Unterbechung findet von Sonntag bis zum Samstag vor dem ersten Pokalspiel statt.